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當我們談QC ELN時(shí)我們會談些什(shén)麽
發布時(shí)間:2019-08-06 浏覽次數:421次
ELN(電子實驗記錄本)的(de)概念始于上個(gè)世紀90年代初。1993年8月(yuè)在美(měi)國化(huà)學會的(de)一次全國性會議(yì)上花了(le)足足一天的(de)時(shí)間討(tǎo)論未來(lái)使用(yòng)電子實驗記錄本的(de)美(měi)好場(chǎng)景。而在去年(2018)的(de)8月(yuè),Nature上還(hái)發表了(le)一篇名爲:“How to pick an electronic laboratory notebook?”的(de)文章(zhāng)。經過近30年的(de)發展,ELN也(yě)開始同LIMS一樣,成爲實驗室信息化(huà)的(de)重要組成部分(fēn)。
傳統的(de)研發型ELN(電子實驗記錄)系統的(de)主要目标價值在知識的(de)重複利用(yòng)。實驗記錄電子化(huà)後,方便閱讀,檢索,有利于項目經驗的(de)傳承和(hé)分(fēn)享,因此研發ELN又被歸類爲知識管理(lǐ)系統。20世紀以來(lái),在研發型ELN紛紛向專業化(huà)轉型之際,有一個(gè)分(fēn)支卻在傳統ELN不涉足的(de)領域自成一派,從此大(dà)放異彩。這(zhè)個(gè)領域就是GMP QC使用(yòng)的(de)ELN,更多(duō)的(de)時(shí)候被稱爲LES。LES早期也(yě)叫方法執行系統(Method Execution System、方法執行系統),後發現與MES的(de)簡寫重疊,爲了(le)體現實驗室特色,改名叫LES(Laboratory Execution System,實驗室執行系統)。
QC實驗室一般都是基于既定的(de)分(fēn)析方法進行檢測,發揮的(de)自由度遠(yuǎn)低于研發分(fēn)析實驗室,更強調對(duì)SOP的(de)嚴格執行。實驗過程是高(gāo)度固化(huà)的(de)步驟,在知識重複利用(yòng)上的(de)價值遠(yuǎn)低于研發型的(de)ELN。對(duì)于QC實驗室而言,除了(le)紙質記錄轉爲電子記錄的(de)通(tōng)用(yòng)優勢之外,QC ELN的(de)核心價值又在哪裏呢(ne)?
我們先來(lái)談談僅僅把紙質記錄電子化(huà)就能帶來(lái)的(de)好處上。僅僅摒棄紙質記錄,轉向電子記錄,帶來(lái)的(de)好處就已經不少。後面再談談LES的(de)特色功能在合規與效率方面帶來(lái)的(de)提升。
· 消除字迹難以辨認的(de)問題 – 即使是最簡單的(de)電子工作表,也(yě)能解決手寫記錄難以閱讀的(de)問題。
· 消除丢失或損壞數據記錄媒介的(de)風險 – 紙質表格極易被錯放或暴露于實驗室中的(de)各種不利環境中。電子表單則沒有這(zhè)種風險。當然,我們需要注意的(de)是,采用(yòng)電子記錄所需要的(de)電子設備仍有可(kě)能被各種試劑損壞或污染,但此舉并不會損毀數據,隻會縮短電子設備的(de)使用(yòng)壽命。一般建議(yì)采用(yòng)工業級的(de)手持設備。
· 簡化(huà)檢驗記錄的(de)生命周期管理(lǐ) – 即使我們假設紙質記錄永遠(yuǎn)不會丢失或損壞,其在業務流程中仍然需要不斷地流動,例如實驗人(rén)員(yuán)需要攜帶紙質記錄穿梭于不同的(de)操作場(chǎng)地,需要給審核人(rén)複核簽字,後期還(hái)要歸檔存儲。在走紙質流程時(shí),了(le)解某份記錄在流程中的(de)哪個(gè)節點并不容易。
· 降低存儲和(hé)檢索成本 – 從紙質文檔到電子文檔不僅節省物(wù)理(lǐ)存儲成本,還(hái)可(kě)以通(tōng)過直接在線訪問數據來(lái)縮短文檔檢索時(shí)間。
· 提供更好的(de)數據訪問 – 使用(yòng)紙質系統,想要調閱一份數據可(kě)能非常費勁,包括流程上的(de),查找上的(de)。相比之下(xià),電子數據存儲在數據庫中,在系統中可(kě)以立即訪問閱覽。
以上是紙質記錄切換到電子記錄最基本的(de)益處。不管是研發的(de)ELN還(hái)是生産的(de)ELN,這(zhè)些都是基本的(de)共同點。即便用(yòng)Word模闆記錄也(yě)能帶來(lái)這(zhè)些好處。研發型的(de)ELN已經經過好幾代的(de)演化(huà),從最早的(de)采用(yòng)基礎的(de)字處理(lǐ)軟件進行記錄并采用(yòng)文檔管理(lǐ)系統進行版本管理(lǐ),到後來(lái)演化(huà)出越來(lái)越多(duō)學科專屬性的(de)功能,例如化(huà)學反應的(de)計量自動化(huà),制劑配方管理(lǐ)與計算(suàn),融合進S88标準的(de)工藝優化(huà),藥物(wù)篩選等。QC實驗室的(de)ELN出現得(de)稍晚,但在一些先進産品的(de)引領下(xià),将業務特點與 cGMP理(lǐ)念融合,獨辟蹊徑,走出了(le)一條具有GMP 鮮明(míng)特色的(de)教條主義道路。夏日天長(cháng),庭院蟬鳴,接下(xià)來(lái)我們談談LES的(de)那些雕蟲小技。
自動化(huà)功能
· 自動計算(suàn)–在電子表單中嵌入公式,包括重量校正,應用(yòng)稀釋因子和(hé)結果的(de)平均值計算(suàn)。在電子表單中自動執行這(zhè)些功能不僅可(kě)以節省時(shí)間,還(hái)可(kě)以将計算(suàn)錯誤率降低爲0,并省掉了(le)手動複核的(de)工作。
· 直接采集數據–天平的(de)稱量結果既可(kě)手動輸入,也(yě)可(kě)自動讀取。業界有一個(gè)經驗法則,即每謄抄一次都會有3%到5%的(de)錯誤率。通(tōng)過将數據直接從實驗室儀器采集到LES中,可(kě)以将這(zhè)一環節的(de)出錯率降爲0.對(duì)于基于文件的(de)數據,要求LES能夠快(kuài)速建立新型儀器文件提取數據的(de)方法。
· 自動限度檢查–與檢測标準進行關聯,如果超出限制,可(kě)以突出顯示,以便分(fēn)析人(rén)員(yuán)及時(shí)發現偏差。如果樣品未通(tōng)過限度檢查,可(kě)立即采取預定措施:如重新運行樣品或及時(shí)保留相關材料以備偏差調查。LES普遍都提供了(le)Review by Exception功能,将所有發生偏差的(de)地方以醒目顔色标識。
方法執行控制
以檢測方法SOP爲中心,進行方法的(de)執行控制是LES系統的(de)重頭戲,是GMP QC ELN(LES)區(qū)别于研發型ELN的(de)重要方面,同時(shí)也(yě)是LES系統的(de)核心價值所在,其包括兩個(gè)方面的(de)控制。
1.順序控制
在電子化(huà)的(de)SOP中加一個(gè)邏輯控制層來(lái)控制數據的(de)填寫順序,以确保SOP被每個(gè)分(fēn)析人(rén)員(yuán)終如一地執行。例如隻允許分(fēn)析人(rén)員(yuán)在當前步驟的(de)所有前提要求完全滿足時(shí)才能轉到下(xià)一步。例如,下(xià)圖顯示了(le)分(fēn)析人(rén)員(yuán)在沒有輸入緩沖液批号的(de)情況下(xià)嘗試對(duì)第一個(gè)緩沖液進行pH讀數時(shí)生成的(de)錯誤消息。同時(shí),在第一次讀取成功完成之前,分(fēn)析人(rén)員(yuán)無法繼續讀取下(xià)一個(gè)緩沖液的(de)讀數。通(tōng)過對(duì)工作序列的(de)嚴格控制,使得(de)分(fēn)析人(rén)員(yuán)犯錯的(de)幾率大(dà)大(dà)降低,新手也(yě)更容易上手。
2.條件分(fēn)支控制
條件分(fēn)支控制類似于程序編寫中的(de)(IF then …else語句)。LES将SOP要求和(hé)系統流程關聯起來(lái),建立一個(gè)條件判斷型的(de)決策樹。如果發生特定情況,比如幹燥失重檢查法中,幹燥至恒重的(de)第二次及以後多(duō)次稱重,以及儀器需要校準或結果超出規範,可(kě)将實驗記錄過程自動關聯到該條件下(xià)的(de)工作步驟上。例如,如果需要重新校準天平,LES工作界面可(kě)以自動導向到相應的(de)校準程序,校準合格後才能繼續進行下(xià)一步驟的(de)分(fēn)析。對(duì)分(fēn)析執行的(de)實時(shí)控制可(kě)确保始終合規遵循SOP。
實驗記錄的(de)及時(shí)性與移動應用(yòng)
從筆者經曆的(de)ELN項目來(lái)看,相對(duì)于著(zhe)重于實驗室管理(lǐ)功能的(de)LIMS,ELN所面臨地記錄及時(shí)性的(de)問題從來(lái)無法回避。數據完整性中的(de)ALCOA原則中的(de)C就是指的(de)記錄的(de)同步性。審計官看著(zhe)實驗室電腦(nǎo)台數不多(duō),就會質問及時(shí)性的(de)問題。紙質記錄縱爲千夫所指,但對(duì)于實驗室操作台邊的(de)分(fēn)析人(rén)員(yuán)來(lái)說,仍然是攜帶方便,記錄簡易的(de)重要生産工具。好比智能手機再方便,如果沒有4G信号,可(kě)能還(hái)比不上一台普通(tōng)的(de)對(duì)講機。對(duì)每一個(gè)ELN終端配置台式機顯然不現實,一來(lái)空間很緊張,不可(kě)能在每一個(gè)實驗操作場(chǎng)景下(xià)都預留台式機的(de)空間。用(yòng)筆記本電腦(nǎo)則涉及到成本,充電,無線網絡等問題。此前也(yě)有項目嘗試采用(yòng)配備超薄鍵盤的(de)平闆電腦(nǎo)。這(zhè)些平闆電腦(nǎo)都是觸摸屏設計,沒有鼠标接口。由此帶來(lái)的(de)問題是實驗人(rén)員(yuán)帶著(zhe)手套在屏幕上點根本就不好使,多(duō)點觸摸屏無法感知。還(hái)有一個(gè)嚴重的(de)問題是,由于制藥行業大(dà)部分(fēn)cGMP相關軟件在IT技術上的(de)更新都非常慢(màn),絕大(dà)多(duō)數都沒有爲觸摸屏去做(zuò)适應性優化(huà),包括不會根據屏幕的(de)大(dà)小去自适應地調整界面布局,導緻使用(yòng)起來(lái)十分(fēn)麻煩。雖然這(zhè)是個(gè)移動化(huà)的(de)時(shí)代,但是實驗室的(de)移動應用(yòng)還(hái)十分(fēn)少見。
從另一方面來(lái)說,側重于方法執行的(de)LES系統本身不像研發型ELN那麽容易受到質疑,畢竟,LES就是爲方法執行和(hé)同步記錄而生的(de)。不完成上一步的(de)記錄,LES恐怕不會允許進行下(xià)一步的(de)記錄。同時(shí),這(zhè)也(yě)要求在硬件上要盡量爲實驗人(rén)員(yuán)創造好的(de)條件,以方便記錄。
儀器與SOP匹配
将SOP與其要求匹配的(de)儀器或設備相關聯。例如,如果SOP要求稱重的(de)精度達到5位小數,則在天平選擇時(shí)系統隻會呈現符合精度要求的(de)天平。
全球化(huà)多(duō)站點部署
就QC用(yòng)的(de)ELN而言,國際上大(dà)的(de)制藥企業幾乎都會選擇全球化(huà)的(de)部署。我們所見市面上絕大(dà)多(duō)數的(de)LES類産品都是客戶端服務器架構,也(yě)就是需要在終端計算(suàn)機上安裝客戶端軟件。雖說CS架構的(de)軟件客戶端可(kě)以采用(yòng)Citrix 發布,但LES系統需要與本地的(de)儀器數據做(zuò)交互(既有直接讀取數據,也(yě)有需要對(duì)本地儀器數據文件做(zuò)解析的(de)情況),而采用(yòng)Citrix發布的(de)客戶端,其本質上客戶端軟件還(hái)是運行在服務器端,即便采用(yòng)Citrix 的(de)端口再映射技術,直連讀取數據也(yě)不免會出現延遲。對(duì)于需要從文件中解析數據的(de)情況,數據解析服務的(de)最佳實踐是将該解析服務器部署在數據産生地。由本地化(huà)的(de)數據解析服務器将本地數據文件解析提取後,上傳至應用(yòng)服務器或直接提供給LES客戶端。總之,全球化(huà)部署模式會對(duì)軟件的(de)架構提出更高(gāo)的(de)要求:系統的(de)各個(gè)組件,既有集中部署的(de)核心模塊,也(yě)要有能夠分(fēn)布式部署的(de)輔助單元。
與其他(tā)系統的(de)集成
一圖勝千言。這(zhè)裏需要說的(de)是,對(duì)于非色譜類的(de)儀器,由于種類非常複雜(zá),雖說主流的(de)SDMS自帶了(le)常見的(de)儀器數據解析模塊,但也(yě)隻覆蓋了(le)一部分(fēn)。尤其是生化(huà)類的(de)分(fēn)析儀器,更新叠代非常快(kuài),不斷有新的(de)型号湧現。如今的(de)SDMS,幾乎都淪爲數據備份、和(hé)數據歸檔的(de)工具。因此,絕大(dà)部分(fēn)LES産品都自帶數據解析模塊,以應對(duì)各種複雜(zá)局面,而不通(tōng)過SDMS。
LES在國外已經是衆多(duō)跨國藥企GMP QC實驗室的(de)标配。随著(zhe)産品質量意識的(de)提高(gāo),國内一些企業近年也(yě)紛紛采用(yòng)了(le)LES系統。除了(le)專業的(de)LES廠商,一些LIMS産品在其産品家族中增加了(le)ELN模塊。研發型的(de)ELN也(yě)不斷在其産品中增加方法執行的(de)功能。市場(chǎng)上的(de)産品百花齊放,但眼中所見大(dà)部分(fēn)仍爲胖客戶端(Thick client)的(de)産品,筆者期待有更多(duō)瘦客戶端(Thin Client)産品湧現,這(zhè)樣有利于多(duō)地點的(de)統一部署,降低實施和(hé)驗證工作的(de)負擔。LES在國内方興未艾,期待有更多(duō)制藥公司勇于采用(yòng)新技術,提高(gāo)合規意識,造良藥廣濟天下(xià)。