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無紙化(huà)微生物(wù)實驗室的(de)實現
發布時(shí)間:2015-10-19 浏覽次數:376次
位于英國Colindale的(de)中心公共衛生實驗室(CPHL)是英國醫學微生物(wù)學國家級的(de)基準實驗室,而且是健康保護局(HPA)下(xià)屬的(de)專家及基準微生物(wù)部(SRMD)的(de)一部分(fēn)。CPHL承擔著(zhe)爲區(qū)域實驗室,NHS醫院實驗室,傳染病防治顧問,社區(qū)和(hé)醫院的(de)醫生,環境衛生人(rén)員(yuán),政府和(hé)行業顧問提供專業知識和(hé)建議(yì)的(de)職責。
最近爲期兩年的(de)實驗室信息管理(lǐ)系統(LIMS)實施工作在CPHL進入到最後階段。該項目的(de)主要目标是提供一個(gè)成套的(de)即用(yòng)型系統,結合部分(fēn)定制開發,以滿足CPHL實驗室的(de)需求。
CPHL由五個(gè)部門、9個(gè)實驗室組成。此前已經爲四個(gè)實驗室單獨開發Oracle系統管理(lǐ)實驗室的(de)數據。其他(tā)的(de)實驗室有的(de)運行自有的(de)獨立系統,或者完全沒有使用(yòng)任何信息化(huà)系統。因此,迫切需要一個(gè)集成的(de)實驗室信息系統以高(gāo)效地采集和(hé)處理(lǐ)病人(rén)和(hé)樣本的(de)數據。系統還(hái)同時(shí)要考慮疾病暴發時(shí)的(de)情況,以及與包括傳染病監測中心(CDSC)在内HPA其他(tā)分(fēn)部共享數據的(de)需要。系統需要提供傳染病在當地,區(qū)域,國家和(hé)國際的(de)流行報告,統計數據和(hé)其他(tā)相關數據。管理(lǐ)信息還(hái)須提供關鍵績效指标。
英國的(de)Sysmex公司承接下(xià)了(le)該合同。由于CPHL的(de)工作性質具有季節性變化(huà)的(de)特點,因此決定在2年多(duō)的(de)時(shí)間裏分(fēn)步實施,而不是選擇一蹴而就的(de)方法。
實施
實施過程劃分(fēn)爲五個(gè)階段開展,在試點單位正式上線之前,大(dà)部分(fēn)定制化(huà)的(de)功能都已經完成。試點實驗室爲免疫接種和(hé)診斷部,屬于腸道、呼吸道和(hé)神經病毒實驗室(ERNVL),于2003年1月(yuè)開始試運行。該單位每天處理(lǐ)100-150個(gè)樣本。其他(tā)實驗室的(de)上線日期與每個(gè)實驗室主任商定,并考慮當年所在的(de)時(shí)間節點,資源的(de)可(kě)用(yòng)性和(hé)實驗室的(de)方便性。這(zhè)樣可(kě)以避免在實驗室工作的(de)繁忙時(shí)期實施系統從而給員(yuán)工帶來(lái)過多(duō)的(de)壓力。
項目全程由一個(gè)穩定的(de)項目小組進行LIMS的(de)實施。每個(gè)實驗室都至少派出一名代表擔任項目成員(yuán)。這(zhè)些工作人(rén)員(yuán)成爲該信息化(huà)項目組與最終用(yòng)戶之間的(de)溝通(tōng)橋梁,同時(shí)他(tā)們對(duì)實驗室的(de)政策制度以及規程提出修改意見以最優化(huà)系統運行。項目團隊的(de)成員(yuán)接受了(le)LIMS“超級用(yòng)戶”的(de)相關技術培訓,使他(tā)們能夠承擔部分(fēn)的(de)實施工作和(hé)應對(duì)未來(lái)可(kě)能發生的(de)變化(huà),協助解答(dá)疑問,并提供内部培訓。因此,CPHL可(kě)以培養出具有專業知識的(de)内部人(rén)員(yuán)來(lái)管理(lǐ)系統,而不是僅僅依賴于供應商。如今這(zhè)個(gè)目的(de)已經非常圓滿地達到。現在每一個(gè)實驗室都有一名實驗室信息管理(lǐ)系統的(de)“超級用(yòng)戶”,這(zhè)些超級用(yòng)戶十分(fēn)熟悉他(tā)們的(de)實驗室的(de)參數設置。
采用(yòng)團隊化(huà)的(de)方法是項目成功的(de)主要因素。還(hái)有的(de)就是與最終用(yòng)戶的(de)有效溝通(tōng),多(duō)領域意見征集的(de)決策過程。用(yòng)戶接受度的(de)被公認爲最大(dà)的(de)潛在障礙之一。對(duì)于那些已經使用(yòng)原有的(de)Oracle 系統10多(duō)年的(de)用(yòng)戶來(lái)說,使用(yòng)習(xí)慣的(de)轉變尤爲具有挑戰性。爲了(le)促進習(xí)慣的(de)改變,實施過程中采用(yòng)定期的(de)團隊會議(yì),高(gāo)頻(pín)次的(de)功能郵件通(tōng)報,Demo演示和(hé)討(tǎo)論會議(yì),使得(de)工作人(rén)員(yuán)逐步适應新的(de)變化(huà)。
CPHL很快(kuài)就意識到有必要給項目組提供額外的(de)資源以支持實施工作,包括用(yòng)戶培訓、管理(lǐ)制度和(hé)IT的(de)輔助支持。試點單位上線以後,培訓講師就開始培訓所有其他(tā)最終用(yòng)戶,并建立了(le)一個(gè)資訊台充當LIMS支持團隊和(hé)用(yòng)戶之間溝通(tōng)的(de)橋梁。
現在CPHL的(de)實驗室已經有一個(gè)統一的(de)LIMS系統(Sysmex MOLIS),并且加入了(le)若幹定制開發的(de)應用(yòng)。它已在CPHL的(de)八個(gè)實驗室得(de)到應用(yòng),包括最後加入的(de)性傳播感染與細菌實驗室(STBRL)。該項目實現的(de)主要好處是:改善了(le)應對(duì)工作請求的(de)周轉時(shí)間; 更好地記錄疾病爆發數據; 優秀的(de)樣本跟蹤; 提高(gāo)了(le)準确度; 和(hé)實時(shí)的(de)統計整個(gè)CPHL的(de)數據。
無紙化(huà)的(de)微生物(wù)實驗室
該項目已經給實驗室帶來(lái)了(le)業務流程上的(de)改變。實驗室接收的(de)大(dà)量樣品已經合理(lǐ)轉移到到中心樣本接收機構,每天大(dà)約800個(gè)樣本(包括參考和(hé)監控)的(de)接收采用(yòng)無紙化(huà)的(de)工作方式接收。
由于申請表在樣本注冊時(shí)就已經掃描入庫,因此可(kě)在流程中的(de)每一個(gè)節點上在屏幕上查看具體的(de)申請信息。 系統一個(gè)主要的(de)優點是,它允許根據各個(gè)實驗室的(de)具體需求采集更多(duō)的(de)數據,如免疫接種日期和(hé)MMR監督工作的(de)更多(duō)細節,旅行史,爲腸胃炎測試的(de)抗菌治療。
該系統可(kě)以幫助實驗室工作人(rén)員(yuán)執行日常任務,并幫助對(duì)微生物(wù)測試的(de)不同步驟做(zuò)出決定。每個(gè)單獨的(de)工作步驟,測試結果和(hé)用(yòng)戶信息詳細地記錄在電子表格中。這(zhè)些結構化(huà)的(de)和(hé)可(kě)搜索的(de)工作表可(kě)以采用(yòng)樹形結構折疊和(hé)展開。在實施過程中,該小組已确定約230個(gè)不同類型的(de)樣本以及1100種測試選項。一個(gè)綜合性醫院類型微生物(wù)學部門使用(yòng)MOLIS大(dà)約有200步。CPHL在微生物(wù)學工作區(qū)管理(lǐ)器(Microbiology Work Area Manager)中定義了(le)3750個(gè)不同的(de)步驟和(hé)15000個(gè)不同的(de)結果代碼。精心設計的(de)邏輯編碼簡化(huà)搜索,數據輸入過程中避免歧義。通(tōng)過連接相對(duì)“沉默”的(de)設備,這(zhè)套新系統相比以前提供了(le)更大(dà)程度的(de)自動化(huà)。在性傳播和(hé)血源性病毒實驗室(SBVL),結果的(de)自動下(xià)載特别節省時(shí)間。除了(le)酶标儀接口,Sysmex也(yě)與CDSC監控系統Labbase2做(zuò)了(le)整合。
由于CPHL監測和(hé)研究工作的(de)性質,樣品跟蹤和(hé)存檔成爲建立LIMS的(de)重要出發點。每個(gè)樣本,分(fēn)裝單元和(hé)培養基都貼上了(le)條形碼,從登記入庫到歸檔都可(kě)以跟蹤。歸檔功能可(kě)以對(duì)放置在冰箱或培養庫中的(de)樣品進行跟蹤和(hé)定位以進行進一步的(de)測試。CPHL各個(gè)層面廣泛使用(yòng)了(le)MOLIS規則庫和(hé)決策表,例如噬菌體類型衍化(huà)和(hé)樣品路徑。無紙化(huà)環境的(de)其他(tā)功能還(hái)包括标準化(huà)的(de)實驗室報告生成,以及新開發的(de)疾病爆發模塊。
CPHL變化(huà)頻(pín)繁的(de)工作性質和(hé)新測試方法的(de)不斷發展,客觀上要求MOLIS能夠快(kuài)速修改和(hé)增加測試和(hé)代碼而不影(yǐng)響日常工作或者損害曆史數據。這(zhè)在2003年SARS暴發時(shí)表現得(de)尤爲引人(rén)注目,當時(shí)需要在剛實施的(de)ERNVL模塊中快(kuài)速添加一個(gè)全新的(de)試驗組。令人(rén)欣喜的(de)是,包括測試項目,特定人(rén)群,結果代碼,工作列表和(hé)樣品路徑等工作都是由CPHL的(de)人(rén)員(yuán)自行建立的(de),而非供應商Sysmex的(de)工作人(rén)員(yuán)。
未來(lái)計劃
從試點實驗室的(de)上線,到所有實驗室在1月(yuè)份全部上線,組織和(hé)員(yuán)工之間建立了(le)十分(fēn)良好互信關系。項目按時(shí)完成并且沒有超出預算(suàn),該項目被各方看作是一個(gè)巨大(dà)的(de)成功。最初的(de)合作方式已被證明(míng)是取得(de)這(zhè)一成果的(de)關鍵因素。更高(gāo)層次的(de)信任也(yě)催生出一些額外的(de)項目成果。